Флаг Михайловского района утверждён 16 февраля 2006 года.

Флаг Михайловского района включён в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под номером 2239.

Идея флага принадлежит Анатолию Сучкову. 

Описание

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования Михайловский район Амурской области в красном, синем (голубом), белом и жёлтом цветах".

Символизм

"Червлёный (красный цвет) символизирует красоту, мужество, смелость, великодушие. 

Выщербленные нижние синяя (голубая) и белая полосы аллегорически указывают на реку Амур – главную водную артерию Михайловского района. 

Белый цвет символизирует мудрость, благородство, откровенность. 

Синий (голубой) цвет символизирует веру, величие, славу и честь. 

Пшеничный колос и стручок сои символизируют развитие в районе сельского хозяйства, как приоритетной отрасли производства. 

Пшеничный колос – символ плодородия, достатка и единства. 

Соя является символом плодородия, богатства и бессмертия. 

Изображение сложенных накрест ключей аллегорически указывает на пограничный международный пункт пропуска, расположенный в районе. 

Ключ – символ безопасности и надёжности. 

Якорь в гербе аллегорически указывает наличие в районе речного порта. 

Якорь символизирует верность, преданность и осторожность".

Источники

• Решение Михайловского районного Совета народных депутатов № 18/275 от 16 февраля 2006 года.

см. также все флаги Амурской области.